Topoľčany hrajú II. ligu v kategórii staršieho i mladšieho dorastu, II. ligu v kategórii starších a mladších žiakov A a III. ligu v kategórii starších a mladších žiakov B. A tri družstvá sú zaradené v regionálnej súťaži prípraviek U11, U10 a U9.
Šéftrénerom mládeže v Topoľčanoch je Peter Januška, ktorý trénuje topoľčianskych žiakov, pôsobí ako učiteľ na ZŠ a od leta je súčasťou reprezentácie Slovenska žien do 17 a 19 rokov v roli asistenta trénera. Spoločne s ostatnými trénermi sa rozhodli, že od nového súťažného ročníka opätovne zavedú žiacke tímy podľa ročníkov narodenia. To sa im aj podarilo, zatiaľ však doplácajú na úzke kádre a v niektorých prípadoch sú niektorí hráči od súperov mladší aj o dva roky, preto výsledky skresľujú skutočnú výkonnosť hráčov.
Mimoriadne zle do súťaže vstúpil starší dorast Topoľčian, ten po piatich kolách bol v druhej lige posledný bez bodu a so skóre 8:53...
– Starší dorast pred súťažou prevzal nový tréner – Kristián Maťko, ktorý je držiteľom licencie UEFA A a v minulosti trénoval dorast ČFK Nitra, či pôsobil ako asistent trénera v FC Nitra U15. Je to veľmi schopný tréner, a keďže starší dorast tvoria hráči ročník 2000, ktorí v skorších mládežníckych kategóriách patrili k najlepším, verili sme, že opäť budú bojovať o horné priečky tabuľky. Dali sa dokopy teda schopní hráči plus tréner a vyzeralo to, že to bude fungovať. Avšak, situácia sa vyhrotila tak, že dorast sa borí v problémoch. V tíme zostali len traja kmeňoví Topoľčanci, zvyšok sú v MFK buď na hosťovaní alebo na striedanom štarte. Teda tento káder môže počas týždňa absolvovať len dve tréningové jednotky, pretože zvyšné dni „cezpoľní“ hráči absolvujú tréningy vo svojich materských tímoch. Niektorí hráči sa stretávajú v podstate len na majstrovských zápasoch.